В основе болезни Фабри — наследственный дефицит а-D-галактозидазы, который приводит к накоплению нейтральных гликосфинголипидов с концевой а-галактозильной группой в клетках почек. У больных с болезнью Фабри обнаружены различные мутации гена a-D-галактозидазы, расположенного на Х-хромосоме. Большинство этих мутаций приводит к классической форме болезни Фабри, при которой страдают не только почки, но и другие органы.
При определенных миссенс-мутациях развивается неполная форма, проявляющаяся лишь гипертрофией левого желудочка.
У мальчиков с классической формой болезни Фабри поражаются почки, сердце, центральная и периферическая нервная система. У гетерозиготных девочек болезнь протекает легко. Поражение почек при болезни Фабри возникает в юношеском возрасте, проявляется небольшой или умеренной протеинурией с эпизодами микрогематурии. Нефротический синдром нехарактерен. В моче можно обнаружить овальные жировые гранулы с двойным лучепреломлением в виде мальтийского креста, что отражает высокий уровень гликосфинголипидов.
Снижение функции почек постепенное, артериальная гипертония и терминальная почечная недостаточность возникают к 40—50 годам. У гетерозиготных женщин поражение почек обычно легкое, но все же возможно развитие терминальной почечной недостаточности. При световой микроскопии подоциты увеличены и заполнены маленькими пустыми вакуолями, которые образуются в процессе гистологической обработки на месте скоплений гликосфинголипидов. Со временем развивается сегментарный или тотальный гломерулосклероз.
При электронной микроскопии выявляется накопление лизосом (главным образом в подоцитах), заполненных слоями плотного вещества, эти слои разделяются пустыми пространствами и располагаются концентричекими кругами или пластами. Прогрессирующее поражение почек и развитие терминальной почечной недостаточности при болезни Фабри, вероятно, вызваны двумя параллельными процессами. Нарушение функции подоцитов, приводящее к протеинурии, сопровождается их отслойкой и некрозом, из-за чего спадаются капилляры клубочка и развивается сегментарный склероз.
В это же время увеличение размеров клеток эндотелия приводит к сужению просвета сосуда, вызывая нарушение артериального кровотока и ишемическое повреждение клубочка. Трансплантация почки — лучший способ лечения ХПН при болезни Фабри, но она не устраняет поражение других органов. Инфаркт миокарда и инсульт — главные причины смерти этих больных после трансплантации почки.