Хотя определяющая цель генетического скрининга — улучшение здравоохранения, он может обладать неумышленными отрицательными последствиями. Как и при генетическом обследовании, аномальные результаты скрининга могут вести к нанесению ущерба репутации, неблагоприятным психологическим последствиям или дискриминации при трудоустройстве или страховании.
Тем не менее при проведении скрининговых программ возникают дополнительные специфические проблемы.
Поскольку генетический скрининг проводят среди множества лиц, есть большая опасность, чем при обычном генетическом обследовании, что скрининг не соответствует высочайшим стандартам информированного согласия или может оказаться результатом открытого или подразумевающегося принуждения к скринингу.
При работе широко распространенной скрининговой программы может пострадать право человека не знать о своих патологических генах. Возникают вопросы, кто имеет доступ к образцам и данным, и как мы можем убедиться, что образцы, например ДНК, не используются для других целей, кроме скрининговых тестов, на которые было дано согласие?
Ясно, что эти вопросы следует учитывать при планировании программ скрининга, требующем этического обзора, чтобы убедиться, что такая озабоченность известна и предприняты соответствующие предупредительные меры.