МедУнивер - MedUniver.com Все разделы сайта Видео по медицине Книги по медицине Форум консультаций врачей  
Рекомендуем:
Стоматология:
Стоматология
Анатомия полости рта
Детская и подростковая стоматология
КТ, МРТ, УЗИ полости рта и ЧЛХ
КЛКТ, КТ, рентген в имплантологии
Ортодонтия:
Ортодонтия
Высота окклюзии
Мини-имплантаты
Ортопедия:
Высота окклюзии
Протезирование коронками
Протезирование мостовидными протезами
Реставрация передних зубов
Штифтовые культевые конструкции (ШКК)
Пародонтология:
Пародонтология
Пластическая хирургия десны
Трансплантация кости (костная пластика)
Терапевтическая стоматология:
Терапевтическая стоматология
Реставрация передних зубов
Штифтовые культевые конструкции (ШКК)
Эндодонтия (эндодотическое лечение)
Хирургическая стоматология:
Хирургическая стоматология
Имплантология
Пластическая хирургия десны
Трансплантация кости (костная пластика)
Форум
 

Секвенирование ДНК при анализе микрофлоры полости рта

Применение ультрасовременного секвенирования ДНК микробиоты полости рта и пародонта в состоянии здоровья и болезни — новейшее технологическое достижение в исследовании этих сообществ. Хотя широкомасштабных исследований выполнено относительно немного, они показали необходимость пересмотра наших оценок видового богатства микробиома полости рта, возможно, на порядок.

К примеру, при изучении микробиоты слюны и наддесневого налета у 71 и 98 здоровых взрослых, соответственно, ампликоны из гипервариабельной области V6 малой субъединицы рРНК были сгенерированы с помощью ПЦР и секвенированы с помощью 454 технологии. После анализа 197 600 последовательностей было предложено сформировать 22 таксона, содержащих 3621 и 6888 вида в слюне и налете, соответственно (Keijser et al., 2008).

Тем не менее эти полученные ранее данные необходимо рассматривать с некоторой осторожностью, так как хорошо известно, что ошибки, присущие пиросеквенированию, особенно гомополимерных путей, могут привести к переоценке общего количества уникальных последовательностей в данном образце. Развитие все более сложного программного обеспечения должно минимизировать эти проблемы и привести к более точным оценкам видового разнообразия микробиома полости рта.

Секвенирование ДНК при анализе микрофлоры полости рта
Рисунок 10. Состав микробиоты на различных участках тела у больных атеросклерозом и контрольной группы, определяемый пиросеквенированием. Графические значения представляют собой среднее содержание последовательностей в каждом типе для 1 700 случайно выбранных последовательностей в образце: а — атеросклеротическая бляшкая; б — полость рта пациента; в — полости рта в контрольной группе; г — кишечник пациента; д — кишечник в контрольной группе.

На самом деле более современные исследования, как правило, дают более сдержанную оценку численности видов (Zaura et al., 2009). Тем не менее применение высокоскоростного секвенирования, в частности, при сравнительном анализе здоровья и болезни, скорее всего, приведет к увеличению диапазона бактериальных видов, связанных с развитием патологии.

К примеру, эта технология была применена для сравнения общей микробиоты полости рта, кишечника и атеросклеротических бляшек у больных атеросклерозом (Koren et al., 2011). Этот всесторонний анализ показал, что видовой состав бактерий из полости рта и, возможно, даже кишечника, могут коррелировать с маркерами атеросклероза (рис. 10).

Большой проблемой в этой области будут анализ и интерпретация больших объемов данных. Так, часто концентрация слишком большого объема детализированной информации по филотипам до уровней типов или родов, как видно из большей части опубликованной литературы по микробному человека, не позволяет сравнивать различные наборы данных. Пока эта проблема не будет решена, эти высокопроизводительные методики не приобретут должного значения.

- Также рекомендуем "Генетическая изменчивость микрофлоры полости рта"

Редактор: Искандер Милевски. Дата публикации: 26.11.2022

Медунивер Мы в Telegram Мы в YouTube Мы в VK Форум консультаций врачей Контакты, реклама
Информация на сайте подлежит консультации лечащим врачом и не заменяет очной консультации с ним.
См. подробнее в пользовательском соглашении.