Определения в генетике: RNAi, ОНП-тег, ТАТА-бокс, VNTR, Y-сцепленное и т.д.
CG (или CpG) островки — любой участок генома, содержащий необычно высокую концентрацию последовательности динуклеотидов 5'-CG-3'. Часто связан с промоторами генов, в частности генов «дворников».
НарМар — набор гаплотипов, определяемых с помощью олигонуклеотидных полиморфизмов всего генома, используемый для исследований ассоциаций с заболеваниями.
р — 1. В цитогенетике — короткое плечо хромосомы (от французского petit — маленький). 2. В популяционной генетике — частота более частого аллеля. 3. В биохимии — сокращение слова «белок» (например, р53 — белок молекулярной массой 53 килодальтона).
PACs (искусственные хромосомы Р1, от англ. artificial chromosomes) — вектор, содержащий клонированную ДНК размером от 100 до 300 килобаз, используется для картирования генов с высоким разрешением и при секвенировании генов.
q — 1. В цитогенетике — длинное плечо хромосомы; 2. В популяционной генетике — частота менее частого аллеля.
RNAi — интерферирующая РНК — регулирует экспрессию генов за счет коротких сегментов РНК (приблизительно 22 основания длиной), формирующих двунитевые структуры с мРНК, что приводит к уничтожению матричной РНК или прекращению трансляции. (См. микроРНК.) Эту эндогенную систему регулирования экспрессии генов применяют для блокирования экспрессии введением RNAi.
ОНП-тег — выборка из множества всех SNP, находящихся в популяции в неравновесном сцеплении друг с другом. SNP-теги используются для формирования минимальных наборов SNP, составляющих гаплотипы, представляющие все частые гаплотипы в этом регионе. См. НарМар.
ТАТА-бокс — согласованная последовательность оснований тимина и аденина в области промотора многих генов, занимающая около 25 пар оснований выше точки старта транскрипции и определяющая эту точку.
VNTR (варьирующее число тандемных повторов, от англ. variable number of tandem repeats) -тип полиморфизма ДНК, создаваемый размещением многочисленных копий коротких тандемных последовательностей ДНК. Благодаря высокой полиморфности, VNTR успешно используется в исследованиях сцепления и для идентификации ДНК при определении отцовства и в судебной медицине.
Y-сцепленное — гены, расположенные на Y-хромосоме, или признаки, определяемые такими генами.
