Хромосомный и геномный анализ с использованием микроматриц. Особенности
При наличии ресурсов проекта «Геном человека» хромосомный анализ можно также проводить на геномном уровне с помощью матричных методов, основанных на технологии CGH.
Чтобы исчерпывающим способом оценить относительное количество копий геномных последовательностей ДНК, используют микроматрицы, содержащие полное представление генома или серию клонированных фрагментов генома, разделенных различными интервалами, проходящие гибридизацию с контролем и образцами больного.
Этот метод, используемый во всевозрастающем числе клинических лабораторий, дополняет стандартное кариотипирование и может обеспечить большую чувствительность и более высокое разрешение в анализе генома. Тем не менее метод CGH-микроматриц измеряет относительное количество копий последовательности ДНК, но не отвечает на вопрос, были ли они транслоцированы или перестроены из своей нормальной позиции в геноме.
Таким образом, важно подтверждение подозрения на хромосомные аномалии методами кариотипирования или FISH для определения характера аномалии и риска повторения как для самого больного, так и для других членов его семьи.
Геномный и хромосомный анализ высокого разрешения могут обнаруживать вариабельность в небольших изменениях числа копий между исследуемыми образцами, клиническое значение которых остается неясным. Все большее количество таких вариантов выявляют и документируют даже в пределах фенотипически нормальной популяции.
Эти геномные варианты могут колебаться по величине от нескольких килобаз до нескольких миллионов пар оснований, и, хотя они обнаружены по всему кариотипу, особенно часто встречаются в субтело-мерных (концевых) и околоцентромерных областях хромосом.
Многие из них, вероятно, окажутся доброкачественными полиморфизмами числа копий (CNP — copy number polymorphism) или вариантов строения, подчеркивающими уникальный характер каждого генома и важность правильной оценки — что считать «нормальным» кариотипом, а что может оказаться патогенным.
