Иногда передача болезни в родословной имитирует моногенное наследование, даже если заболевание не имеет моногенной основы. Легко ошибиться при анализе тератогенных эффектов, некоторых типов наследуемых хромосомных болезней, например сбалансированных транслокаций, или влияния факторов окружающей среды на членов одной семьи.
Наследственные моногенные заболевания обычно отличаются от этих типов семейных заболеваний своим типичным менделирующим коэффициентом сегрегации в пределах родословной. Подтверждение того, что семейная болезнь — следствие мутаций в единственном гене, в конечном счете, предполагает обнаружение дефектов на уровне продукта гена или в самом гене.
Существует также класс заболеваний — сегментные анеусомии, имеющие нехватку или избыток двух или более генов в соседних локусах в хромосоме из-за делеции, дупликации или утроения целого сегмента ДНК.
При этом фенотипы — так называемые синдромы генных последовательностей, вызванные изменением числа копий более чем одного гена, — часто показывают типичный менделирующий коэффициент сегрегации, обычно с доминантным типом наследования, поскольку сегментные анеусомии передаются как единственный мутантный аллель.
Примеры включают аутосомно-доминантную болезнь Паркинсона, вызванную утроением региона участка длиной приблизительно 2 мегабазы в длинном плече хромосомы 4; аутосомно-доминантный велокардиофациальный синдром, фенотип которого вызван делециями миллионов пар оснований ДНК, кодирующей многочисленные гены в 22qll.2; и Х-сцепленный синдром атрофии сетчатки, глухоты и умственной отсталости, вызванный делецией, по крайней мере, трех локусов в участке Xq21.
