Ген андрогенового рецептора (АР) был клонирован в 1988 г. и локализован в Х-хромосоме человека между центромерой и ql3. Как и прогестероновый рецептор (ПР), анрогеновый рецептор (АР) существует в двух формах: В-форме с нормальной длиной и укороченной А-форме (с молекулярными массами ~110 и 87 кДа соответственно); обе формы кодируются одним и тем же геном.
Изоформа 87 кДа (АР-А) содержит интактный С-терминал, но в ней недостает 188 аминокислотных остатков N-терминала изоформы 110 кДа (АР-В). Соотношение АР-А/АР-В в фибробластах кожи гениталий здоровых людей составляет 10:1. Неизвестно, имеются ли функциональные различия между этими изоформами. ДНК-связывающий домен или TAF-2 андрогенового рецептора сходен с регионами TAF-2 других рецепторов к стероидным гормонам (прогестерону, эстрогену, глюкокортикоидам и минералокортикоидам), но более всего с прогестероновым рецептором (ПР).
Прогестерон проявляет перекрестную реактивность с андрогеновым рецептором (АР), но лишь в степени, которая становится значимой только при фармакологических дозировках.
В большинстве тканей тестостерон превращается в дигидротестостерон (ДГТ) под действием фермента 5а-редуктазы. Дигидротестостерон (ДГТ) связывается с андрогеновыми рецепторами с большей аффинностью, чем тестостерон, обеспечивая лучшую стабилизацию рецептора и более эффективную передачу сигнала, что усиливает андрогенный эффект. В связи с этим интенсивность локального превращения тестостерона в ДГТ является важным внутриклеточным фактором андрогенного ответа.
Описано множество мутаций андрогеновых рецепторов (АР), которые нарушают их функцию. Например, инактивирующие точечные мутации в гормонсвязывающем домене андрогенового рецептора (АР) могут обусловливать несколько фенотипов — от частичной до полной потери чувствительности к андрогенам. Точечная мутация в остатке 689 (замещение Про на Гис) может изменять конформацию лигандсвязывающего домена, что приводит к снижению аффинности андрогеновых рецепторов (АР) к дигидротестостерону (ДГТ) и лишает его способность к трансактивации гормонспецифических элементов (ГСЭ).
Замещение Сер на Про в остатке 865 препятствует связыванию андрогена и трансактивации; иными словами, эта мутация тоже приводит к полной потере чувствительности к андрогенам. Замещение Тре на Мет в остатке 807 вызывает частичную потерю чувствительности к андрогенам за счет снижения (но не устранения) связывания андрогена с рецептором. Однако замещение Вал или Арг в том же участке полностью препятствует связыванию с андрогеном и приводит к развитию синдрома отсутствия чувствительности к андрогенам.