Возбудители природно-очаговых инфекций включены в род Flavivirus семейства Flaviviridae. Флавивирусы представлены сферическими вирионами диаметром 37-50 нм.
Геном флавивирусов образует однонитевая молекула +РНК, заключённая в капсид с кубическим типом симметрии. Снаружи капсид покрывает суперкапсид, содержащий гликопротеиновые шипы около 10 нм длиной.
Репродукция флавивирусов происходит в цитоплазме. После созревания дочерние популяции отпочковываются от клеточной или внутриклеточных мембран, служащих местом сборки вирионов. Поражения у человека проходят по типу системных (вирусы Денге, Вессельброн) и геморрагических лихорадок (жёлтая лихорадка), энцефалитов (вирусы энцефалитов Сент-Луи, долины Мюррей, Повассан, Росио, клещевого и японского энцефалитов) и смешанных поражений, протекающих с развитием лихорадки и энцефалита (лихорадка Западного Нила).
Эпидемиология инфекций вызываемых флавивирусами
Флавивирусы выделяют в регионах с тёплым и умеренным климатом. Для значительной части инфекций, особенно в умеренном климате, характерна сезонность, обусловленная активностью переносчиков.
Принадлежность более 60% флавивирусов к арбовирусам определяет их связь с позвоночными животными и членистоногими переносчиками.
Природным резервуаром и основными хозяевами флавивирусов являются клещи и комары, передающие возбудителей трансовариально. Важную роль в поддержании циркуляции вирусов в эндемичных очагах играют позвоночные, у которых развивается длительная вирусемия, обеспечивающая заражение большого количества переносчиков.
В циркуляцию флавивирусов человек включается случайно и является тупиковым хозяином, так как человек не способен заразить большое количество переносчиков. Часть флавивирусов циркулирует аналогично тогавирусам, например вирус энцефалита Сент-Луи передаётся от москитов птицам, а человек — тупик инфекционного цикла.
Однако в экологии флавивируса - возбудителя жёлтой лихорадки человек и обезьяны — основные хозяева и природный резервуар, а в зависимости от участия переносчика выделяют городскую (комары) и сельскую, или джунглевую (москиты), формы заболевания. Некоторые вирусы (например, вирус клещевого энцефалита) могут передаваться трансмиссивно или через инфицированное козье молоко.
Эпидемические вспышки инфекций вызываемых флавивирусами носят случайный характер и обусловлены заражением необычайно большого количества людей (например, при освоении новых территорий).