При чрескожном введении клонидина требуется много времени (обычно 48—72 ч), чтобы концентрация препарата в плазме достигла терапевтического уровня, и чрескожное применение необходимо дополнять пероральным приемом клонидина на ранних этапах лечения гипертензии и при проявлениях синдрома отмены.
Применение пероральной формы клонидина, как правило, чаще сопровождается побочными эффектами, чем применение чрескожной формы. Наиболее распространенные побочные эффекты — вялость и сухость во рту.
Симптомы могут длиться до 72 ч. После удаления избыточного количества лекарства посредством рвотных средств, промывания желудка и суспензии активированного угля проводится симптоматическая и поддерживающая терапия, предполагающая применение жидкостей, введение атропина, а в некоторых случаях применяют наружную кардиостимуляцию — при брадикардии с угрозой гемодинамической неустойчивости.
При полном промывании кишечника у одного из пациентов клонидиновый пластырь вышел с промывными водами из прямой кишки.