Полость рта, её слизистая оболочка и лимфондные ткани челюстно-лицевой области играют важнейшую роль во взаимодействии организма человека с окружающей средой.
Микроорганизмы, обитающие в полости рта, с одной стороны, способствуют перевариванию пищи и синтезу витаминов, с другой — образуют продукты, повреждающие ткани зубов. Аг этих микроорганизмов стимулируют активность факторов иммунобиологической резистентности организма, но в полости рта проявляют иммуносупрессивное и токсическое действие на ткани десны и периодонт.
Микроорганизмы, обитающие в полости рта, — антагонисты патогенной флоры, и в то же время резидентная микрофлора полости рта сама способна вызывать развитие серьёзных заболеваний.
Плотность микробной колонизации полости рта сравнима с таковой в кишечнике. В частности, 1 мл слюны содержит от 4 млн до 5 млрд микроорганизмов; 1 г зубного налёта — 10-1000 млрд. В полости рта доминируют бактерии, представленные относительно стабильной группой аэробов и анаэробов, спектр которых может варьировать в пределах 120-200 видов. Многообразие видов объясняют гигиеническими привычками, состоянием зубов, возрастом и т.д.