«Сцепленные с полом» заболевания вызываются мутациями в генах X хромосомы. Поскольку мужчины имеют только одну X хромосому, такие мутации будут манифестировать у них. Гетерозиготные женщины являются «носителями», либо клинически здоровыми, либо заболевание проявляется у них в легкой форме.
Важным признаком Х-сцепленного наследования является наличие больных мужчин (или страдающих гораздо более тяжелой формой заболевания, чем женщины) и отсутствие передачи от отца к сыну. Дочери больных мужчин являются облигатными носителями. Вероятность передачи мутации женщиной-носителем своему потомку составляет 50%, вероятность развития болезни у сыновей — 50%, и вероятность «носительства» у ее дочерей также составляет один к двум.
Женщины-носители глазных болезней. В соответствии с классическими представлениями, о том, что Х-сцепленными заболеваниями болеют только мужчины. Это верно для таких болезней, как ретиношизис и болезнь Норри. Однако фенотипические проявления других заболеваний, например, Х-сцепленного пигментного ретинита (xLRP), могут наблюдаться и у женщин-гетерозигот,хотя и в более легкой форме и с более поздним дебютом, чем у мужчин. Это затрудняет генеалогическое исследование Х-сцепленных заболеваний и увеличивает значение тщательно собранного анамнеза.
Фенотипические проявления у женщин бывают очень вариабельны вследствие инактивации Х-хромосомы. При некоторых Х-сцепленных заболеваниях у женщин могут развиваться характерные глазные симптомы, несмотря на отсутствие жалоб (хороидеремия, синдром Лоу), что способствует диагностике и выявлению носителей.
Как и при доминантном наследовании, описаны возникающие de novo мутации генов X хромосомы, и в случаях изолированного заболевания мужчин, матери которых по результатам исследования клеток крови не являются носителями, нужно помнить о возможности гонадного мозаицизма.