Первоначально вирус гриппа размножается в эпителии верхних отделов дыхательных путей, вызывая гибель инфицированных клеток. Через повреждённые эпителиальные барьеры вирус проникает в кровоток. Вирусемия сопровождается множественными поражениями эндотелия капилляров с повышением их проницаемости.
В тяжёлых случаях наблюдают обширные кровоизлияния в лёгких, миокарде и паренхиматозных органах. Взаимодействие возбудителя гриппа с иммунокомпетентными клетками приводит к существенному нарушению их функциональных свойств с развитием явлений транзиторного иммунодефицита и аутоиммунопатологии.
Продолжительность инкубационного периода гриппа составляет 1-3 дня, после чего наступает продромальный период, проявляющийся общим недомоганием, чувством разбитости и т.д. Основные симптомы — быстрое повышение температуры тела до 37,5-38 °С с сопутствующими миал-гиями, насморком, кашлем, головными болями; продолжительность лихорадочного периода — 3-5 сут.
Наиболее тяжёлые случаи вызывают так называемые токсигенные штаммы (возбудителей гриппа типа «испанки»), особенно при наличии лёгочно - сердечной патологии. Они протекают очень бурно с быстрым развитием крупозной пневмонии.
Частое осложнение гриппа — бактериальные пневмонии, вызванные в большинстве случаев активацией аутомикрофлоры зева и носоглотки (обычно стрептококков группы Б). Во время пандемии «испанки» в 1918-1919 гг. погибло более 20 млн человек, в основном от вторичных бактериальных пневмоний.
Вследствие высокой антигенной вариабельности вируса гриппа выздоровление не приводит к развитию стойкой невосприимчивости к повторным заражениям.