Генетический скрининг. Генетическая ассоциация болезни
Генетический скрининг — основной метод обследования популяции для определения лиц с повышенной предрасположенностью или риском генетической патологии. Скрининг на уровне популяции нельзя путать с обследованием больных или поиском носителей в семьях, уже идентифицированных по семейному анамнезу. Цель популяционного скрининга — изучить всех участников определенной популяции, независимо от семейного анамнеза.
Генетический скрининг — важный раздел организации здравоохранения, все более значимый, по мере того как становится доступным большее число качественных скрининг-тестов для определения генетической предрасположенности к болезням.
Обнаружение генетического вклада в здоровье или болезнь имеет очевидную значимость для исследований этиологии и патогенеза болезни, а также для определения потенциальных целей для хирургических и терапевтических вмешательств. Тем не менее в медицинской практике решение о возможности выявления индивидуумов с повышенной предрасположенностью к болезни зависит от клинической достоверности и клинической полезности теста.
Клиническая достоверность — вероятность предсказания болезни в результате теста.
Клиническая полезность теста — степень, с которой результаты теста изменяют медицинскую помощь конкретному больному и, как следствие, улучшают медицинские и экономические результаты. Клиническую полезность можно оценивать как для скринируемой личности, так и для популяции в целом.
Генетическая ассоциация болезни — отношение между генотипом предрасположенности (или защищенности) и фенотипом болезни. Генотип предрасположенности (защищенности) может быть определен как присутствие аллеля (у гетерозигот или гомозигот), только гомозиготный генотип, гаплотип, содержащий аллели в граничных локусах, или одинаковые комбинации генотипов в разных локусах.
Независимо от того, какой тест используют для правильного обнаружения генотипа у каждого тестируемого человека (аналитическая достоверность теста), клиническая достоверность показывает, насколько хорошо генотип предсказывает фенотип, и наоборот. Клиническая достоверность зависит от чувствительности и специфичности теста для фенотипа, т.е. числа ложноотрицательных и ложноположительных ответов.
Тем не менее при встрече с конкретным пациентом врачу, практикующему персонализированную генетическую помощь, хотелось бы знать больше, чем то, насколько чувствителен или специфичен используемый тест. Третья сторона клинической достоверности также представляет интерес: какова достоверность того, что конкретный генотип дает информацию о риске для пациента по конкретной болезни, не относительно лиц без такого генотипа, а в абсолютных цифрах?
Эта сторона клинической достоверности определяется прогностической ценностью положительного результата и прогностической ценностью отрицательного результата теста для этой болезни. Соотношение между некоторыми из таких понятий наилучшим образом может быть показано в помощью таблицы 2x2.
• Частота генотипа предрасположенности = (a+b)/N.
• Распространенность болезни = (a+c)/N (случайная выборка или полное обследование популяции).
• Относительный риск — отношение частоты болезни у носителей генотипа предрасположенности к частоте болезни у неносителей генотипа предрасположенности: Относительный риск = (a/(a+b)/c(c+d).
• Чувствительность — доля индивидуумов с генотипом предрасположенности, у которых развилась болезнь =а/(а+с).
• Специфичность — доля лиц, не имеющих генотипа предрасположенности среди здоровых =d/(b+d).
• Прогностическая ценность положительного результата — доля больных конкретным заболеванием среди индивидуумов с генотипом предрасположенности =а/(а+b).
• Прогностическая ценность отрицательного результата — доля здоровых по конкретному заболеванию среди индивидуумов без генотипа предрасположенности =d/(c+d).
