Соматические клетки человека содержат диплоидный (2n = 46), а половые — гаплоидный (n = 23) наборы хромосом. Неполовые хромосомы (аутосомы) нумеруются по мере уменьшения их длины (от 1 до 22), а половые хромосомы указываются отдельно (X и Y).
Систематизация хромосом по парам и идентификация измененных хромосом в каждой отдельной метафазной пластинке, согласно Международной цитогенетической номенклатуре, создает кариотип клетки. Нормальный мужской кариотип — 46, XY, нормальный женский 46, XX.
Каждая хромосома разделена центромерой (перетяжкой) на два плеча: короткое, которое по международной номенклатуре обозначают латинской буквой р, и длинное — q. Терминальные участки хромосомных плеч называют теломерными.
При специальной окраске каждая хромосома приобретает индивидуальный рисунок, плечи хромосом выглядят поперечно исчерченными, в них видны светлые и темные полосы (bands) разной интенсивности. Эти полосы пронумерованы и объединены в районы (regions). Район может содержать несколько полос.
При описании любого участка хромосомы, в том числе перестроенного, используют 4 показателя:
1) номер хромосомы;
2) плечо;
3) район;
4) полоса.
Например, 14q32 (место локализации гена Н-цепей иммуноглобулина, область перестроек при В-клеточных лимфомах и остром лимфобластном лейкозе) — длинное плечо хромосомы 14 и вторая полоса района 3.
Различают числовые и структурные изменения кариотипа.
Пример сложной транслокации с участием трех хромосом: 10, 11 и 17
Применение FISH на интерфазных ядрах, а не на метафазных хромосомах (интерфазный анализ) позволяет за короткое время изучить сотни клеток. Метод быстро развивается, совершенствуется, количество зондов растет. В настоящее время уже многие специфические хромосомные аномалии могут быть обнаружены с помощью FISH.
Можно проводить FISH на клетках, окрашенных по Романовскому—Гимзе или в сочетании с различными цитохимическими и иммунохимическими методиками. Это создает условия для изучения гистогенеза клеток, в которых произошли изменения кариотипа.
В хорошо оборудованных лабораториях используется дорогостоящая установка для спектрального анализа хромосом SKY (multicolor spectral karyotyping), в основе SKY тоже лежит принцип FISH. Эта установка позволяет увидеть весь кариотип, причем каждая хромосома окрашивается в свой цвет.
Использование SKY дает возможность улавливать большинство транслокаций, поскольку маркеры, возникшие в результате обмена между хромосомами, окрашенными в разные цвета, состоят из разноцветных участков. Такие маркеры очень демонстративны, и при определенном опыте легко увидеть и понять, какие хромосомы приняли участие в перестройке и образовании маркеров.
Существуют опухоли и лейкозы, при которых происхождение маркерных хромосом невозможно установить без применения SKY или некоторых других модификаций FISH. Изредка возникают ситуации, когда надежную информацию о кариотипе можно получить только при сочетанном использовании перечисленных методических приемов.