Практически во всех семейных и спорадических случаях лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии 1А у больных имеет место делеция участка в субтеломерной области хромосомы 4q35, состоящего из большого числа тандемных повторов длиной 3,3 кб [van Deutekom et al., 1993]. Чем большей является протяженность делеции, тем тяжелее клинические проявления заболевания [Fitzsimons R., 1999]. Предполагается, что данная делеция посредством изменения структуры хроматина в области 4q35 приводит к нарушению экспрессии близлежащего гена FRG1 или других генов, расположенных проксимальнее точки разрыва, что и лежит в основе развития болезни [Fisher, Upadhyaya, 1997; Kleinjan, van Heyningen, 1998].
Необычный механизм мутации носит название негативного позиционного эффекта (эффект положения). Указанная делеция в локусе 4q35 затрагивает сайт распознавания для рестрикционной эндонуклеазы ЕсоRI, поэтому прямая ДНК-диагностика болезни может проводиться с помощью рестрикционного анализа с данным ферментом и последующей блот-гибридизации с соответствующим зондом. Диагноз лице-лопаточно-плечевой ПМД достоверен в случае выявления атипично короткого рестрикционного EcoRI-фрагмента длиной менее 28 кб (в норме >35 кб) [Fisher, Upadhyaya, 1997].
Определенные затруднения при проведении прямой ДНК-диагностики лице-лопаточно-плечевой мышечной дистрофии связаны с тем, что рестрикция геномной ДНК ферментом ЕсоRI приводит к появлению в рестрикционной смеси фрагментов ДНК гомологичного участка хромосомы 10q26, имеющих сходные размеры с фрагментами хромосомы 4q35 [Tawil R. et al., 1998; Fitzsimons R., 1999]. Эти затруднения удается преодолеть либо с помощью электрофореза в пульсирующем поле, обеспечивающего более тонкое разделение крупных фрагментов ДНК, либо путем дополнительной обработки рестриктазой В1п1, специфически расщепляющей «посторонние» 10q26-генерированные фрагменты ДНК [Deidda G. et al., 1996].
Использование таких усовершенствованных процедур ДНК-анализа позволяет успешно диагностировать заболевание в 95% случаев лице-лопаточно-плечевой ПМД [Galuzzi G. et al., 1999]. В остающихся 5% случаев может иметь место: а) «промежуточная» длина рестрикционного фрагмента от 28 до 35 кб, что затрудняет трактовку электрофореграммы; б) кроссинговер между гомологичными участками хромосом 4q35 и 10q26 с транслокацией делетированпого l0q-фрагмента в субтеломерную область хромосомы 4q, что может приводить к болезни и не диагностироваться описанными методами ДНК-анализа; 3) форма лице-лопаточно-плечевой ПМД 1В, не сцепленная с локусом 4q35 [Tawil R. et al., 1998; Fitzsimons R., 1999].
В настоящее время в мире накоплен большой опыт практической ДНК-диагностики лице-лопаточно-плечевой ПМД, включая диагностику асимптомных случаев носительства мутации и пренатальную ДНК-диагностику.