В более поздней фазе развития, когда большая часть желтка уже использована, а в результате этого наступило уменьшение желточного мешка в объеме, эмбрион вынужден использовать в качестве питания вещество яичного белка. В связи с этим аллантоис увеличивается настолько, что со временем он заполняет все пространство экстраэмбрионального целома, как это видно на приведенных схематических изображениях.
Выводной проток аллантоиса, то есть узкая трубочка, посредством которой аллантоис сообщается с каудальным кишечником, называется мочевым путем зародыша — urachus. Этот urachus при сужении пупочного отверстия попадает в непосредственное соседство с пупочно-кишечным протоком. В мезодермальном слое, который снаружи окружает энтодермальную стенку аллантоиса, образуется нежная сеть капиллярных сосудиков, при слиянии которых возникают будущие пупочные сосуды (vasa umbilicalia).
Этим своим мезодермальным васкуляризированным слоем стенка аллантоиса прилегает к внутренней мезодермальной стенке хориона, и обе мезодермы (хориона и аллантоиса) срастаются между собой. В результате этого из стенки аллантоиса и хориона образуется единая васкуляризированная оболочка, называемая хорио-аллантоис, которая снаружи граничит с веществом яичного белка. На противоположном полюсе яйца он образует складки, между которыми находится белок. Благодаря этому становится возможной резорбция яичного белка, который перерабатывается васкуляризированным хорио-аллантоисом (или хорио-аллантоисной мембраной) и поступает в зародыш через аллантоисные пупочные сосуды.
Хориоаллантоис располагается над телом эмбриона вблизи воздушной камеры яйца, благодаря чему является возможным газообмен, иными словами дыхание зародыша. Кроме того аллантоис функционирует в качестве экскреторного органа и резервуара для продуктов распада и продуктов эмбрионального метаболизма, которые накапливаются в аллантоисной жидкости. Выводной проток аллантоиса открывается в мешкообразное расширение заднего кишечника — в клоаку, куда выходят и выводные пути половых органов.
Клоака сохраняется у птиц и во взрослом состоянии, в то время как у высших организмов и у человека в процессе развития она закладывается лишь как переходное, временное образование.
Из сказанного вытекает большое физиологическое значение аллантоиса. В филогенетическом развитии по восходящей к человеку его значение постепенно падает; таким образом, у человека аллантоис является рудиментарным зачатком, который не выполняет столь важные функции, как у птиц. Однако еще и у человека в его мезодерме возникают закладки пупочных сосудов (vasa umbilicalia), которые в данном случае, в связи с измененным способом жизни зародышей высших млекопитающих и человека приобретают большое значение.
